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KNIME、EXCEL、R、Pythonなどの備忘録

【KNIME】構造情報を一覧で見やすくしたい

・先日、Tile Viewで情報を見やすく成型したが、構造情報をうまく表示することができなかった。

・Tile Viewは対応するセルの情報をカードに出力してくれるのだから、画像データをそのまま渡せばよいのでは?と思って調べたところ、SMILESの構造情報を画像として出力することができるノードがあるらしい(以下の参考の74ページあたりに出てくるRenderer to Imageノード)。

Hands-on: Data preparation and interactive visualization of chemical structures in KNIME
Analytics Platform
AIDD April 19th, 2022
Daria Goldmann KNIME AG

https://ai-dd.eu/sites/default/files/online/Daria_Goldmann_KNIME.pdf

・これを、Tile Viewで表示すれば良いかもしれない。

・ということで、ワークフローを組んでみた(以下)。

・Renderer to Imageノードが、SMILESを画像に変換してくれる(以下、設定と出力)。

・これをTile Viewに渡すと、それっぽく表示してくれた(下図)。

・いろいろな変数を与えることで、構造と変数を一緒にカード形式で表示することもできそう。

 

おわり