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KNIME、EXCEL、R、Pythonなどの備忘録

回帰問題

【KNIME】curve fittingで酵素反応速度論的パラメータを推定してみたい(非線形回帰)。

・酵素反応速度論的解析をする際に、モデルの式に数値を当てはめてパラメータを推定するcurve fittingをやりたかったのだけれど、KNIMEでのやり方が分からなかった。 ・Pythonなら出来そうだったので、KNIMEにPythonを入れ込んで、サンプルデータのfittingを…

【KNIME】回帰分析に適用するモデルを決めたい(Pycaret)

・教師あり学習に使うモデルを決めるために、PythonのライブラリPycaretをKNIMEで実行してみた。 ・まず、先日作成したPythonの仮想環境にPycaretを入れようとインストールしようとしたが、上手くいかなかった。 ・knimeenvを作成した際にconda create -n kn…

【その他】回帰モデルの評価指標のいろいろ

・回帰モデルの評価指標にも、いくつか種類がある。少しまとめてみた。・R2 (決定係数):1 に近いほど精度の高い予測が行えていることになる。が、案外癖のある指標。定義が色々ある。相関係数の二乗は、いろいろある決定係数の一つのらしい(決定係数と呼ば…

【KNIME】Random Forest Regressionで回帰問題を解きたい

・分類問題を試してみたので、次は回帰問題を試してみたい。 ・やり方は分類問題と全く同じで、Random Forestの回帰問題版を使用した(下図) ・サンプルデータセットとしては、ボストン家賃データセットを用いた。その他の設定はすべてデフォルトで、モデル…