・先日、化学構造からMordredを用いてDescriptorをたくさん算出した。 ・1600を超えるDescriptorを提示いただけたが、エラーが生じているものも少なくなかった。そこで、エラーが生じた記述子列を除去するワークフローを考えてみた（下図）。 ・ここでいうエ…

・先日KNIMEでk-meansクラスタリングなどを実施してみた。k-meansクラスタリングの特徴は、プロットした空間中で中心から距離をベースに考えるところで、要は2次元グラフ上なら丸く分布していないと綺麗に分けることができない。 ・歪んだ分布の場合、Spectr…

・生物系の実験で、プレートリーダーで得られたデータを解析することで、試験物質のin vitro活性を評価することがしばしばある。 ・KNIMEでこの解析が自動化できないか調べてみたところ、ExtensionのCommunityノードで、HCS Toolというものがあった。これを…