・Table Row to Variable
KNIME
化学的な
・SDF Reader
・RDKit MCS
・Table Row to Variable
・RDKit Substructure Filter
・RDKit Moleculer Highlighting
・先日に引き続き、化合物を少し触ってみたい。例えば共通の構造を分かりやすく表示出来たら面白いな、と思ったので、少し調べてやってみた。 ・今回は、CheMBLから適当にsdfのデータセットを落としてきたので、読み込むのはsdf readerノードで実施した。構…
KNIME
機械学習
Python
回帰問題
分子生物学的な
・Table Creator
・Python Script
・String Manipulation
・Table Row to Variable
・Concatenate
・Color Manager
・Scatter Plot
・Add Empty Rows
・Math Foumula
・酵素反応速度論的解析をする際に、モデルの式に数値を当てはめてパラメータを推定するcurve fittingをやりたかったのだけれど、KNIMEでのやり方が分からなかった。 ・Pythonなら出来そうだったので、KNIMEにPythonを入れ込んで、サンプルデータのfittingを…
・KNIMEでflow variableを扱う際に、Table Creatorで適当に表を作り、Table Column to Variable又はTable Row to Variableで変数化することがある。 ・何故か2分の1以上の確率で間違うので、記事にしておく。 ・適当に表を作って、それぞれで変数化した（下…
・Column Filterで表から列を抽出（又は除外）する際に、Flow Variableで列名を指定したい。 ・例えば、左下の表からVariables 1（a）という名前の列を抽出する場合、以下のように組むことがある。 ・この際に、単純に"Column Filter"の"Flow Variables"で”i…
