・Cell Splitter
・Table Creator
・RowID
・Transpose
・Cell Splitter
・Column Filter
・GroupBy
・Reference Column Resorter
・Tile View
KNIME
・化合物情報などを扱う際に、列名が冗長化したりして、視認性が悪くなる場合がある。そこで、冗長なところを纏めつつ、表をTile Viewで視認性良く表示するワークフローを作成した。 ・入力データは以下の表(化合物のID、分子量、IC50(_等号・不等号、_値…
KNIME
化学的な
・SDF Reader
・RDKit Fingerprint
・Fingerprint Similarity
・Cell Splitter
・String Manipulation
・Column Filter
・Column Rename
・RowID
・化合物の構造を、何らかの形で纏めたいと思った。 ・一つのやり方として、機械的に類似度を算出し、似ている化合物は同じ性質をもつだろうと推測する手法があると思う。 ・例えば、A、B、C、Dの4つの化合物がある場合、Aと一番似ている(A-B、A-C、A-Dの…
・先日、化合物をKNIMEで扱ってみた。 ・化合物の構造ファイルとして、いろいろな記述法があり、中でもSMILESとSDFはよく見かける。 ・SMILESの特徴は、1次元の文字列の配列であり、記述自体がシンプルであること。SDFの特徴は、化合物の構造以外の情報も盛…