・化合物の構造を、何らかの形で纏めたいと思った。 ・一つのやり方として、機械的に類似度を算出し、似ている化合物は同じ性質をもつだろうと推測する手法があると思う。 ・例えば、A、B、C、Dの４つの化合物がある場合、Aと一番似ている（A-B、A-C、A-Dの…

・先日、化合物をKNIMEで扱ってみた。 ・化合物の構造ファイルとして、いろいろな記述法があり、中でもSMILESとSDFはよく見かける。 ・SMILESの特徴は、1次元の文字列の配列であり、記述自体がシンプルであること。SDFの特徴は、化合物の構造以外の情報も盛…