・Column Rename
KNIME
化学的な
・SDF Reader
・RDKit Fingerprint
・Fingerprint Similarity
・Cell Splitter
・String Manipulation
・Column Filter
・Column Rename
・RowID
・化合物の構造を、何らかの形で纏めたいと思った。 ・一つのやり方として、機械的に類似度を算出し、似ている化合物は同じ性質をもつだろうと推測する手法があると思う。 ・例えば、A、B、C、Dの4つの化合物がある場合、Aと一番似ている(A-B、A-C、A-Dの…
KNIME
クラスタリング
可視化
機械学習
Python
・Table Creator
・Python Script
・Scatter Plot
・Column Rename
・Column Appender
・Color Manager
・先日KNIMEでk-meansクラスタリングなどを実施してみた。k-meansクラスタリングの特徴は、プロットした空間中で中心から距離をベースに考えるところで、要は2次元グラフ上なら丸く分布していないと綺麗に分けることができない。 ・歪んだ分布の場合、Spectr…
・生物系の実験で、プレートリーダーで得られたデータを解析することで、試験物質のin vitro活性を評価することがしばしばある。 ・KNIMEでこの解析が自動化できないか調べてみたところ、ExtensionのCommunityノードで、HCS Toolというものがあった。これを…