いろいろ倉庫

KNIME、EXCEL、R、Pythonなどの備忘録

環境構築

【ubuntu】condaでRstudioの環境を作ってみる

・お題:condaでRStudioの環境を作ってみたい。 ・ズブの素人なので間違っていたら生暖かく見てほしい。 ・なお、ubuntuというよりcondaの話なのだけれど、ubuntuでやったのでなんとなくタイトルにubuntuを入れてみた。 ・ condaで環境を作る。 conda create…

【ubuntu】解析環境のsifを作るdefファイルを作りたい

・お題:遺伝子発現をR studio serverで構築するsifを作成するのが面倒なので、sifを構するdefファイルを作りたい。 ・私は素人なので、間違っていても生暖かく見守ってほしい。 ・apptainerでは、sifファイルから環境を立ち上げる。sifファイルはdocker ima…

【ubuntu】apptainerでR studio serverを立ててみたい

・お題:すごい人たちは、コンテナというもので仮想環境を作ってうまいこと解析を回しているらしい。apptainerというソフトが計算科学の分野でよく使われるらしいので、これでR studio serverを立ててみたい。 ・前置き(言い訳)として、私はズブの素人なの…