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KNIME、EXCEL、R、Pythonなどの備忘録

統計

【Python】p値を補正したい

・お題:多重検定したので、p値を補正したい。 ・多重比較検定をすると、familywise error rateが上昇してしまうことが知られている。詳しくは以下を参照。 www.med.osaka-u.ac.jp ・そこで、得られたp値を補正したい。 ・Pythonでp値を補正するには、statsm…

【Python】t検定してみたい

・お題:Pythonを使ってt検定してみたい。pingouinという統計のライブラリを使ってみたい。 ・統計といえばR、というイメージがあるが、今回はPythonで統計をやってみたい。また、Scipyではなく、pingouinというライブラリ(以下リンクを参照。pip install p…

【KNIME】生存時間解析してみたい。

・生存時間を評価する手法として、Kaplan-Meier法という手法がある。これは、生存率曲線を描くことで、生存時間(期間)を推定する手法。 ・2群間の生存時間を比較する統計手法としてよく用いられるのは、ログランク検定と一般化Wilcoxon検定だろう。Cox比例…

【KNIME】統計解析してみたい

・KNIMEには、ある程度の統計解析機能がデフォルトで搭載されている(下図)。また、デフォルトでない解析であっても、Extensionを入れれば非常に多様な解析をカバーできる。 ・例えば、A、B各群n=10から得られたデータのセットに対して、Independent groups…

【その他】統計解析のサンプルデータセットを入手したい。

・以前、データセットの入手先に関して記事にした。 ・統計解析のデータセットで良いものはないか? ・特に統計解析に使うデータセットの場合ら、理想を言えば、このデータセットに対してこういう統計手法を使えば、こういう結果が得られるよ、ということま…