KNIMEとか倉庫

KNIMEやEXCELなどの備忘録です。

・Transpose

【KNIME】データの表を見やすくしたい

・化合物情報などを扱う際に、列名が冗長化したりして、視認性が悪くなる場合がある。そこで、冗長なところを纏めつつ、表をTile Viewで視認性良く表示するワークフローを作成した。 ・入力データは以下の表(化合物のID、分子量、IC50(_等号・不等号、_値…

【KNIME】化合物のChEMBL IDから構造情報を纏めてとってきたい

・諸般の事情で、化合物のChEMBL IDのリストと活性情報が手に入ったが、構造情報が付与されていなかったとする。 ・化合物数が10や20なら個別に構造を検索しても問題ないだろうが、それが数十、数百にもなるといよいよ面倒になってくる。 ・そこで、ChEMBLの…

【KNIME】棒グラフに色を付けたい。

・散布図はcolor managerノードで簡単に色を付けることができたが、棒グラフ(Bat Chart)のカラムに色を付ける方法が分からなかった。 ・少し癖があったので、メモしておく。 ・以下のようなフローを組んだ。 ・左のウィンドウはTable Creatorの中身。各列…

【KNIME】表全体でString Manipulationしたい。

・たくさん列のある表全体に対して同じString Manipulationの処理を実行したい時がある。 ・String Manipulationは、1つの列に対してしか機能しないので、Loopを使って列を一つ一つ処理していく必要がある。 ・例えば、表中の「田中」を「鈴木」に変換するW…