KNIMEとか倉庫

KNIMEやEXCELなどの備忘録です。

【KNIME】化合物のDescriptorを計算してみたい

・分子の性質を語るために、計算科学的に算出される指標のことを、記述子(Descriptor)と呼ぶ。このDescriptorにはいろいろな種類があり、ケモインフォマティクスの分野では必要に応じていろいろ使い分けられている。

・KNIMEで化合物の構造情報を扱っていると、Descriptorを算出していろいろすることもあるかもしれない。KNIMEにRDKitのExtensionをインストールしているのであれば、RDKit Descriptor Calculationノードが便利かもしれない(以下)。

hub.knime.com

・例えば、以下のような感じで使う、、、のかもしれない。

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・ちなみに、RDKit Descriptor Calculationノードでは、算出したいDescriptorを選ぶことができる(下図)。

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・ざっくり119個のDescriptorが算出されたっぽい。

 

終わり。