【KNIME】化合物だって階層型クラスタリングしてみたい。

・前回に引き続き、化合物を構造でまとめたい。

・今回は階層型クラスタリングをしてみたい。

・ワークフローを組んでみた（下図）。

・流れは以下の通り。

①SDF読み込み。

②情報抽出。今回はchembl_id（RowIDに設定）と構造情報だけにした（下図）。

③Fingerprint算出。Fingerprintが何かは以下が凄く良く纏まっている。すごい。

future-chem.com

④類似度を算出。

⑤階層型クラスタリングモデルを構築。

⑥データをモデルに当て嵌めたり、図示したりする（下図）。