・お題：生体内の様々な分子は相互作用し、絶妙なバランスを保っている。生体内の分子の役割を理解するのに、ネットワーク解析が有効らしい。学んでみたい。 ・私は素人なので、参考サイトをなぞるような形で学んでいきたい。今回は以下のサイトを参考に学ば…

・お題：生体内の様々な分子は相互作用し、絶妙なバランスを保っている。生体内の分子の役割を理解するのに、ネットワーク解析が有向らしい。学んでみたい。 ・私は素人なので、参考サイトをなぞるような形で学んでいきたい。今回は以下のサイトを参考に学ば…

・お題：生体内の様々な分子は相互作用し、絶妙なバランスを保っている。生体内の分子の役割を理解するのに、ネットワーク解析が有効らしい。学んでみたい。 ・私は素人なので、参考サイトをなぞるような形で学んでいきたい。今回は以下のサイトを参考に学ば…

・お題：生体内の様々な分子は相互作用し、絶妙なバランスを保っている。生体内の分子の役割を理解するのに、ネットワーク解析が有効らしい。学んでみたい。 ・私は素人なので、参考サイトをなぞるような形で学んでいきたい。今回は以下のサイトを参考に学ば…

・お題：次元圧縮の手法で、主成分分析というやつがある。軸を引き直して情報の寄与の大きい軸だけとり出すことで、次元を下げるらしい。よく分からないので、体感してみたい。 ・例えば10次元の変数セットを主成分分析で軸を取り直し、寄与の大きい軸トップ…

・お題：細胞一つ一つのオミクス情報を解析する手法をシングルセル解析と呼ぶらしい。Seuratというライブラリを使ってやってみたい。 ・私は素人なので、以下のチュートリアルをなぞってみたい。 satijalab.org ・前回、チュートリアルのPCAのヒートマップを…

・お題：細胞一つ一つのオミクス情報を解析する手法をシングルセル解析と呼ぶらしい。Seuratというライブラリを使ってやってみたい。 ・私は素人なので、以下のチュートリアルをなぞってみたい。 satijalab.org ・インストールは以下を参照。 satijalab.org …

・お題：遺伝子発現の多寡を解析するパッケージとして、EdgeR、DESeq2、limmaなどいろいろあるらしい。今回もDESeq2をやってみたい。 ・私は素人なので、tutorialをなぞる感じで学んでいきたい。今回のtutorialは以下。正しいことは元サイトを見て頂きたい。…

・お題：遺伝子発現の多寡を解析するパッケージとして、EdgeR、DESeq2、limmaなどいろいろあるらしい。今回もDESeq2をやってみたい。 ・私は素人なので、tutorialをなぞる感じで学んでいきたい。今回のtutorialは以下。正しいことは元サイトを見て頂きたい。…

・お題：遺伝子発現の多寡を解析するパッケージとして、EdgeR、DESeq2、limmaなどいろいろあるらしい。今回もDESeq2をやってみたい。 ・私は素人なので、tutorialをなぞる感じで学んでいきたい。今回のtutorialは以下。正しいことは元サイトを見て頂きたい。…

・お題：遺伝子発現の多寡を解析するパッケージとして、EdgeR、DESeq2、limmaなどいろいろあるらしい。今回はDESeq2をやってみたい。 ・私は素人なので、tutorialをなぞる感じで学んでいきたい。今回のtutorialは以下。正しいことは元サイトを見て頂きたい。…

・お題：処理の一部を関数化することがあるけれど、いちいち関数を作成するのもめんどくさい。関数を集めたモジュールを作成し、読み込むだけで関数を使えるようにしたい。 ・関数とモジュールの関係は、関数が「具体的な計算機能」のこと、モジュールが「関…

・お題：Pythonで共通構造を持つ低分子化合物を弄っていた。構造情報を分かりやすく示したい。 ・以下のサイトなどを参考にさせて頂いた。正しいことは元サイトをご確認いただきたい。 qiita.com ・まず、化合物の構造を落としてくる。今回はchemblから化合…

・お題：Tableauという探索的データ解析ツールがあるらしい。PandasのDataFrameを使ってTableuっぽくグラフを描くパッケージでPyGWalkerというやつがあるらしい。Tableauは有料っぽいので、PyGWalkerを使ってみたい。 ・PyGWalkerのGitHubは以下。正しいこと…